热烈祝贺本组的科研论文被CCF B类国际会议IEEE BIBM 2024接收(图)

近日,本人以第一作者身份向IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) 2024 第一轮投稿的文章被接收,论文题目为 “stGCLF: a versatile deep graph contrastive learning framework for spatial transcriptomics analysis “。湖南科技大学为第一完成单位,中南大学计算机学院李敏教授为通讯作者,本组硕士研究生余俊楠参与设计了核心实验。

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IEEE 生物信息学和生物医学国际会议 (BIBM) 已成为生物信息学和生物医学领域首屈一指的研究会议。 IEEE BIBM 2024将于2024年12月3日至6日在葡萄牙里斯本举行。IEEE BIBM 2024 为传播生物信息学和健康信息学的最新研究提供了一个顶尖的论坛。它汇集了来自计算机科学、生物学、化学、医学、数学和统计学的学术和工业科学家。该会议被CCF收录为B类会议。

空间转录组学(ST)的快速发展彻底改变了对空间异质性的研究,并增加了对有效表征空间领域的全面方法的需求。作为ST数据分析的先决条件,空间领域的表征是下游分析和生物解释的关键步骤。在该文中,我们提出了一种用于空间转录组学的深度图对比学习框架(stGCLF),通过图卷积网络利用对比学习来有效学习各个点之间的特征,解决了跨平台泛化能力差的问题。通过交替进行属性和拓扑去噪,我们的方法降低了ST数据中的噪音。本文展示了stGCLF 在空间转录组学的领域识别、轨迹推断、多切片整合和类型注释方面的有效性。

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